При обмене с 1С отключаются (удаляются) товары, не участвовавшие в обмене.
Отключение (удаление) корректно производится именно по окончании полного процесса обмена.
Если обмен по каким-то причинам не прошел до конца и прервался на середине процесса, то отключение (удаление) товаров не происходит.

Создавалось для версии 2.3.7.
Скорее всего, годится и для других версий 2.x