1. В админке у категории добавлено поле market_category, в котором из выпадающего списка можно выбрать категорию из дерева категорий Яндекс.Маркета, соответствующую категории магазина.
2. Категории Ямаркета берутся из текстового файла. При необходимости файл можно менять, например, исключая категории, заведомо неподходящие по профилю магазина.
3. В выгрузке в Ямаркет у товара добавляется тег market_category, если категория маркета указана у (основной) категории товара.

Создавалось для версии 2.3.7.
Скорее всего, годится и для других версий 2.x